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全能核酸酶的水溶液在280nm波长处有特征吸收峰（源于酪氨酸、色氨酸的芳香环结构），摩尔消光系数约为2.8×10? L/(mol?cm)，可通过 A???值结合比浊法测定酶浓度。
10mg/mL的全能核酸酶水溶液，25℃时动力黏度约为1.2~1.5mPa?s，与水的黏度接近，具有良好的流动性，便于工业生产中的管道输送与分装。
重组全能核酸酶经高度纯化后，杂蛋白含量＜0.1%，其分子结构中无特异性抗原表位，溶解后不会因蛋白聚集产生免疫原性风险，符合生物制药的安全要求。